Да, ранее выданный документ можно применять до окончания переходного периода на продукцию (дата зависит от технического регламента). Но в Вашем случае дата окончания переходного периода для продукции уже прошла, поэтому такой документ применять нельзя, но частности лучше согласовать с таможенным постом. В стандартном случае ГОСТ Р сертификат уже не принимают и следует оформлять ТР ТС сертификат на продукцию.